Prof. Graefen ist Mitbegründer und Leiter der Martini-Klinik am UKE GmbH, Prostatakrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf.
Sein Spezialgebiet sind die Diagnostik und Therapie des Prostatakarzinoms.
Er ist wissenschaftlicher Autor von über 400 peer-reviewed Artikeln überwiegend zum Prostatakarzinom sowie Mitglied der deutschen Leitlinien-Kommission Prostatakrebs.